La misión del consorcio es crear y desarrollar nuevas variedades frutales  mediante Breeding (mejoramiento genético convencional), apoyado por el uso de Biotools e Ing. genética, y luego, por medio de escalamiento y transferencia, incorporarlas al sector privado para su comercialización.   

El consorcio opera en un modelo de innovación abierta, desarrollandose proyectos de forma colaborativa y coordinada, cuyos resultados tienen por destino final la industria frutícola.